中国农业大学动科学院李孟华教授课题组通过山羊T2T基因组组装揭示与绒用性状相关的变异
日期:2024-12-04 13:38
),这些区域被认为是错误组装的修正或新组装,其中超过30 Mb位于X染色体上。这些 PURs 主要由着丝粒卫星序列和片段重复(SDs)组成,占 PURs 总长度的 81.92%(236.33 Mb)。此外,T2T-goat1.0修正了ARS1中大量的组装结构错误,例如,18号染色体19 Mb26 Mb区域的倒位,该倒位通过原始reads比对被确认是 ARS1的组装错误。T2T-goat1.0 中鉴定到286.70 Mb 的非冗余片段重复,其中73.28%(210.12 Mb)位于着丝粒区域,而在ARS1中仅发现了55.25 Mb。
  为了评估T2T-goat1.0作为参考基因组在reads比对和变异检测的改进,研究收集了516个山羊
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