中国农业大学动科学院李孟华教授课题组通过山羊T2T基因组组装揭示与绒用性状相关的变异
日期:2024-12-04 13:38
  本研究利用PacBio HiFi(141.03 Gb,49.3)、Ultra-long ONT(328.44 Gb,114.8)、Bionano(1188.9 Gb)和Hi-C(435.76 Gb,152.2)测序技术,组装了山羊首个完整基因组(T2T-goat1.0),其大小为2.86 Gb,包括20.96Mb的Y染色体。T2T-goat1.0的QV值达到了54.18,且全基因组的覆盖度均匀。
  T2T-goat1.0与山羊参考基因组ARS1具有高度共线性,进一步验证了T2T-goat1.0的高质量和准确性。T2T-goat1.0成功填补了ARS1中的649个gap,并完整解析了着丝粒和端粒区域。T2T-goat1.0共鉴定到288.5Mb的之前NCBI参考基因组ARS1未解析区域(PURs
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