将杀菌锅装上产品后关闭锅门，设定杀菌温度、杀菌时间。打开蒸汽角座阀自动开启进行锅内升温，在即将达到温度时，通过温度变送器准确的把锅内温度输送到温控仪，控制蒸汽角座阀进行温度调节，此调节阀是根据锅内温度的升降进行逐步调节，以防止锅内到达温度时，温度反冲。在达到设定温度的同时，自动关闭蒸汽角座阀门，进入产品杀菌阶段（不同产品杀菌时间可调）。杀菌时锅内低于设定温度，交座阀门自动打开。温度升到设定温度自动关闭，使锅内始终保持设定温度。直到杀菌时间结束，杀菌锅的蒸汽对流设计，使锅内蒸汽循环杀菌，温度均匀杀菌无死角。报警器报警。
产品进入冷却阶段，开启水泵，把凉水输送到锅内，达到设定水位时停止，随即打开循环阀门，把锅内凉水进行循环，使产品温度均匀下降。如工作时间较长，锅内凉水降不下温时，打开溢水阀，把锅内上部热水排出，同时其它凉水进入，以达到降温目的.
锅内压力由压力变送器随着锅内压力的升降，把信号输送到压力控制仪，进行锅内压力自动调整，使锅内压力始终处于在规定的范围内。如超出，可自动停止；如下降，可自动加压保护。使锅内产品处于同等压力下进行杀菌。在锅内达到工艺设定的冷却温度后，随即把锅内凉水排出，卸掉锅内压力，杀菌完毕，操作工人打开连锁装置，开启锅门取货。
