整治行动中，食品药品监管部门将完善食品追溯、召回等制度，确保食品原料来源渠道清晰，销售去向明确，全过程可追溯，对问题食品要及时主动召回并依法处置。在有条件的区县推动畜禽肉制品生产企业实行过期产品集中销毁，严厉打击使用工业明胶等非食用物质，使用过期回收或者腐败变质食品再加工肉制品，以及掺杂使假、以次充好，超范围超限量添加防腐剂、色素等食品添加剂等违法生产加工行为。
在流通环节，北京市要求规范供应、采购渠道，严格市场准入，大型商场、超市要优先选择信誉良好，具有一定规模的供应商；农副产品批发市场要严格执行“场厂挂钩”、“产销联合体”制度，禁止产销联合体以外的肉源进入市场，确保上游主渠道安全；零售市场要严格落实“批零挂钩”制度，保证下游渠道安全可追溯。
打击食品违法行为，食药监和公安、动检、缉私等相关部门加强对城乡周边、进京关口、贸易口岸等重点区域的执法检查，重点打击畜禽产品“黑窝点”、“黑物流”，全面捣毁违法网络。对发现的违法违规行为，一律从快、从严处理；情节严重的，一律吊销生产经营者的许可证；涉嫌犯罪的，一律移送公安机关依法追究刑事责任。
北京市还将积极引导公众参与，充分发挥有奖举报作用，鼓励社会大众主动提供案件线索，及时排查风险隐患。12331投诉举报热线随时接待对违法行为的投诉举报。
北京作为特大消费型城市，平均每日上市猪肉140万公斤、牛羊肉上百万公斤、蔬菜210万公斤、米面近400万公斤、鸡蛋330万公斤，这些食品中的85%以上都由外埠供应。其中，河北、山东、天津、辽宁、河南、吉林等六地的猪肉供应份额超过90%，其中牛羊肉95%以上由河北、天津供应，鸡鸭肉95％以上来自山东、天津、河北三地。2013年至今，全市食品安全总体合格率保持在97.3%以上，六类重点食品的总体合格率保持在98.2%以上。
